Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc163A2AGD7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.6 ms