Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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