Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rabgef1Q9JM13 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rabgef1Q9JM13 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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