Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Scamp5Q9JKD3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Scamp5Q9JKD3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms