Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gpa33Q9JKA5 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms