Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp29Q9ES63 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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