Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rnft1Q9DCN7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnft1Q9DCN7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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