Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc97Q9DBT3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms