Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms