Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pramef12Q9D2F1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms