Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc6bQ9D289 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms