Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Susd3Q9D176 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Susd3Q9D176 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
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Susd3Q9D176 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Susd3Q9D176 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms