Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms