Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms