Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Smim8Q9CQQ0 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Smim8Q9CQQ0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms