Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Nicn1Q9CQM0 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms