Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl17Q9CPR4 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms