Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup155Q99P88 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms