Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms