Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Brms1Q99N20 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Brms1Q99N20 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms