Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp1b4Q99ME6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms