Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Prpf19Q99KP6 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf19Q99KP6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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