Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Apobec3Q99J72 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms