Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm28Q8CGC6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbm28Q8CGC6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbm28Q8CGC6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbm28Q8CGC6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbm28Q8CGC6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbm28Q8CGC6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbm28Q8CGC6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbm28Q8CGC6 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbm28Q8CGC6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbm28Q8CGC6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbm28Q8CGC6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm28Q8CGC6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms