Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms