Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cwc22Q8C5N3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms