Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hdac7Q8C2B3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hdac7Q8C2B3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms