Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms