Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms