Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rpp38Q80UU2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms