Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NischQ80TM9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NischQ80TM9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms