Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sgo2Q7TSY8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sgo2Q7TSY8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sgo2Q7TSY8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sgo2Q7TSY8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms