Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Shq1Q7TMX5 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Shq1Q7TMX5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms