Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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