Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms