Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sin3aQ60520 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sin3aQ60520 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms