Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psme4Q5SSW2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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