Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim58Q5NCC9 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms