Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.4 ms