Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edc4Q3UJB9 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms