Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms