Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Puf60Q3UEB3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms