Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms