Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Nuf2-203ENSMUST00000192248 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Crem-209ENSMUST00000129435 1160 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rnf166Q3U9F6 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf166Q3U9F6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms