Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Rnf149Q3U2C5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rnf149Q3U2C5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rnf149Q3U2C5 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rnf149Q3U2C5 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rnf149Q3U2C5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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