Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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