Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hoxc4Q08624 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hoxc4Q08624 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc4Q08624 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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