Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnb1Q03717 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms