Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms