Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shc1P98083 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1556.4 ms